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古越族遺裔說
百越，即聚居我國東南和南部的原住民的統稱，實際上包含了諸個不同的民族，例如居於今日福建的「閩越」、居於今日廣東的「南越」等。他們都有不同的語言與文化，「百越」只是他們的籠統稱呼。
由於地理因素，古越族大多善於操持舟楫，這從西漢南越王博物館的銅提筒紋飾可見一斑───南越王趙眜墓出土的9件銅提筒，其中有一件刻上了戰船紋飾：4艘首尾相連的小船，船上載着戴上羽冠的船員5名，而船與船之間還有魚、龜等動物裝飾。
另外，有不少文獻也記錄了越人善操舟楫。《漢書‧嚴朱吾丘主父徐嚴終王賈傳》：「臣聞越非有城郭邑里也，處谿谷之間，篁竹之中，習於水鬥，便於用舟，地深昧而多水險……」，說明了越人慣處於溪流河谷之間，也善用「用舟」；《吳越春秋‧勾踐伐吳外傳‧勾踐二十五年》：「越王喟然歎曰：『越性脆而愚，水行山處，以船為車，以楫為馬，往若飄然，去則難從，悅兵敢死，越之常也……』」，指出越人使用船楫猶於他族驅使車馬；《淮南子‧齊俗訓》：「胡人便於馬，越人便於舟」，也點明了越人用舟，無異胡人駕馬。
彼等文物、文獻都說明了越人與今稱之「疍家人」一樣，皆善操船楫，故有些學者推論疍民為古越族遺裔。《隋書‧卷八十二‧列傳第四十七》：「南蠻南蠻雜類，與華人錯居，曰蜒，曰狼，曰俚，曰獠，曰頠，俱無君長，隨山洞而居，古先所謂百越是也」，「蜒」，「疍」之同音字，明確指出疍民源自百越。後來，顧炎武、羅汝南、蔣炳釗等學者，皆認同此說。至於為什麼這群越族後裔會長居於海，清代《南海縣志》認為是因為秦始皇南平百越之時，殺越之西甌王，越人不想當「秦民」，所以都逃入江海之中，以「舟楫為宅」、「捕魚為業」。
越人船隻模型。（Wikimedia Commons）
盧循餘黨說
盧循，字于先，小字元龍，范陽涿縣（今河北涿州市）人，是東漢名儒盧植之後。東晉末年，孫恩發動「天師道」信眾起兵反晉，盧循隨之，史稱「孫恩盧循之亂」。元興元年（402年），孫恩兵敗自殺，其餘部數千人逐推舉盧循為首領，後接受朝廷招安。盧循雖然接受任命為永嘉太守，但不久復叛。其後，因朝廷勢大，盧循唯有攻下南海郡治所番禺作為根據地，並自稱「平南將軍」。義熙七年（411年），盧循遭劉裕所敗，勢孤力弱，遂與妻妾、兒女自殺。其餘黨遂遁入荒島，捕魚為業，成了今日之疍民。而這群「盧循餘黨」聚居於今日香港大嶼山和寶安縣南亭竹沒山一帶。
「盧循餘黨說」亦見於部分文獻之中，如唐代劉恂《嶺表錄異》（卷上）記載了一個叫做「盧亭」的族群：「盧亭者，盧循昔據廣州，既敗，餘黨奔入海島，野居，惟食蠔蠣，壘殼為牆壁」。又，南宋周去非《嶺外代答‧外國門下》曾記：「廣州有蜑一種，名日盧停，善水戰」，「停」為「亭」之同音字，而周去非在此明確指出「盧亭」就是「蜑」（疍民）的一種。
關於盧亭，有一個小插曲：傳說盧亭是出沒於今日大嶼山的半人半魚的生物。屈大均《廣東新語‧鱗語》記曰：「人魚之種族有盧亭者，新安大魚山與南亭竹沒老萬山多有之。其長如人，有牝牡，毛髮焦黃而短，眼睛亦黃，面黧黑，尾長寸許，見人則驚怖入水，往往隨波飄至，人以為怪，競逐之。有得其牝者，與之媱，不能言語，惟笑而已。久之，能著衣，食五穀。攜至大魚山，仍沒入水。蓋人魚之無害於人者。人魚長六七尺，體髮牝牡亦人，惟背有短鬣微紅，知其為魚。間出沙汭能媚人，舶行遇者，必作法禳厭」，「盧亭」跟今日想像中的「人魚」十分相似，估計是當時的人對長居於海上的疍民的一種幻想，繼而形成的一種傳說。
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